近日,《Journal of Integrative Plant Biology》在線發(fā)表了海南大學南繁學院王守創(chuàng)教授團隊題為“A SlMYB78-regulated bifunctional gene cluster for phenolamide and salicylic acid biosynthesis during tomato domestication, reducing disease resistance”的研究論文。首次揭示植物抗病代謝通路中存在雙功能基因簇(BGC2),其核心基因 SlEPS1在馴化中因負選擇導(dǎo)致功能衰退的分子機制:其編碼的雙功能酶兼具催化抗菌物質(zhì)酚胺與免疫激素水楊酸的雙重功能,為植物代謝與抗病研究提供新路徑。
該研究對401份番茄群體材料的酚胺物質(zhì)進行了檢測,通過基于代謝物全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)鑒定出2號染色體上與酚胺合成基因簇(BGC2)。實驗證明基因簇中核心組分SlEPS1參與水楊酸和酚胺的生物合成,其關(guān)鍵氨基酸殘基 His169對酚胺合成至關(guān)重要,且SlEPS1的雙酶活性與增強的抗病性相關(guān)(圖1)

圖1 酚胺BGC2基因簇的定位與鑒定
通過比較不同番茄亞群中SlEPS1位點的核苷酸多樣性,發(fā)現(xiàn)該基因可能受人工選擇影響。變異組分析發(fā)現(xiàn)番茄群體間有兩個不同的SlEPS1單倍型組合:SlEPS1HapA和SlEPS1HapB,其中SlEPS1HapB的植株中酚胺和SA水平更高,抗病性更強。這些結(jié)果表明,在番茄的馴化選擇過程中,SlEPS1HapB的消失可能是導(dǎo)致番茄抗病性降低的原因之一(圖2)。

圖2 SlEPS1馴化遺傳分析
此外,研究還發(fā)現(xiàn)了一個與BGC2顯著共表達的轉(zhuǎn)錄因子SlMYB78。它能夠直接結(jié)合并激活BGC2基因簇的啟動子,從而調(diào)控BGC2基因簇的表達。當SlMYB78基因被沉默時,酚胺和水楊酸的含量顯著下降,導(dǎo)致其抗病能力降低(圖3)。

圖3 SlMYB78正調(diào)控基因簇,促進酚胺和水楊酸的積累
綜上所述,番茄馴化過程中,SlMYB78調(diào)控的雙功能基因簇BGC2因抗病單倍型SlEPS1HapB被負選擇,導(dǎo)致現(xiàn)代番茄酚胺和水楊酸減少,抗病性顯著下降??梢酝ㄟ^基因編輯恢復(fù)SlEPS1HapB功能或增強SlMYB78活性的抗病育種策略,為培育高抗優(yōu)質(zhì)番茄提供理論支撐。
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